IUU-Fischerei trägt dazu bei, dass die wissenschaftlichen Berechnungen zu Größe und Entwicklung von Fischbeständen ungenauer werden. Häufig gründen die Wissenschaftler:innen ihre Berechnungen auf die Fangdaten der vergangenen Jahre – illegale und undokumentierte Entnahmen bleiben dabei unberücksichtigt.
IUU-Fischerei ist nach wie vor eine der größten Bedrohungen für die Meeresökosysteme, da sie in der Lage ist, die nationalen und regionalen Bemühungen zur nachhaltigen Bewirtschaftung der Fischerei und dem Erhalt der biologischen Vielfalt der Meere zu untergraben.